黑莓果汁饮料代加工冷杀菌方法有物理杀菌和化学杀菌两大类。物理杀菌是运用物理手段，如场（包括电场、磁场）、高压、电子、光等的单一作用或者两种以上的共同作用，在低温或常温下达到杀菌目的的方法。常见的物理杀菌技术有超高压脉冲电场杀菌、脉冲强光杀菌、高压静电场杀菌、半导体光催化杀菌、微波杀菌和辐照杀菌等。
黑莓果汁饮料代加工的杀菌工艺选择原则：既要杀死微生物，又要尽可能减低对产品品质的影响。常用的方法：高温短时(93±2℃/15~30s)。杀菌后的灌装：高温灌装(热灌装)和低温灌装(冷灌装)。果实饮料，除纸质容器外，几乎都采用热灌装(由于满量灌装，冷却后果汁容积缩小，容器内形成一定的真空度)罐头中心温度>70℃。
黑莓果汁饮料代加工萃取得到的果汁会继续氧化和酶化，即使保存在冷藏环境也会在五天内变坏。必须采用额外的处理工艺，对于冷榨果汁技术，高压处理（HPP）是更好的选择。果汁中存在大量的氧气，会使果汁中的vc遭破坏，氧与果汁中的各种成分反应而使香气和色泽恶化，会引起马口铁罐内壁腐蚀，在加热时更为明显。常采用真空脱气法，氮气交换法。
